В 2008 году проблематика охраны окружающей среды стала одним из приоритетных направлений российской политики. 18 ноября в Государственном Кремлевском Дворце состоялась четвертая Всероссийская Конференция «Новые приоритеты национальной экологической политики в реальном секторе экономики», на которой было намечены основные направления деятельности по оздоровлению экологической обстановки в стране. В частности, обозначены задачи перехода на экологическое нормирование по показателям наилучших доступных технологий, повышение экологической ответственности российских корпораций, изменение системы экологических платежей, сокращение количества «экологических поборов», связанных с получением разрешительных документов, и другие актуальные проблемы в области природопользования.
МГУП «Мосводоканал» традиционно уделяет большое внимание охране окружающей среды при повышении барьерной роли очистных сооружений по снижению антропогенной нагрузки на природу, обеспечения надежного и экологически безопасного производства, соблюдения норм и требований природоохранного законодательства и комплексного подхода к использованию природных ресурсов.
В настоящее время разработана и реализуется Программа природоохранных мероприятий МГУП «Мосводоканал» на 2008-2010 годы, которая включает широкомасштабные работы по реконструкции и модернизации очистных сооружений, охрану водоисточников, восстановление водных объектов и рекультивацию земель, исследования технологий, направленные на снижение негативного воздействия, и ведомственный мониторинг окружающей среды. Программа согласована с Ростехнадзором, МОБВУ, Роспотребнадзором, ДЖКХиБ. Объем финансирования программы ориентировочно составляет 4,5 млрд.руб в год.
5 июня 2008 года в День эколога предприятие получило Премию Правительства Москвы в области охраны окружающей среды за внедрение блока ультрафиолетового обеззараживания на Люберецких очистных сооружениях.
С целью снижения негативного воздействия на окружающую среду МГУП «Мосводоканал» совместно с Московским Управлением Ростехнадзора впервые в России реализует проект по работе с абонентами городской канализации, целью которого является снижение сбросов загрязняющих веществ в водные объекты.
Данные ведомственного мониторинга качества воды в водных объектах постоянно передаются в МОБВУ, Ростехнадзор, Московскую единую систему мониторинга.
Большое внимание уделяется на предприятии работам по сертификации на соответствие международным стандартам. С целью повышения экологической эффективности работы на предприятии проводятся работы по внедрению системы экологического менеджмента в соответствии с ИСО 14001.